دستورالعمل های ایمنی بی شماری برای نگهداری و ذخیره و همچنین کار با نیترات آمونیوم در دسترس است. اطلاعات ایمنی و بهداشتی در برگه های داده های ایمنی موجود نشان داده شده است. نیترات آمونیوم خالص نمی سوزد، اما به عنوان یک ماده شیمیایی اکسید کننده قوی، نیترات آمونیوم احتراق مواد آلی (و برخی مواد غیر معدنی) را تسریع می بخشد. نیترات آمونیوم نباید در مجاورت مواد قابل احتراق نگهداری شود. در حالیکه نیترات آمونیوم در دما و فشار محیط در بسیاری از شرایط پایدار است، ممکن است از به دلیل یک بار و شارژ ناگهانی منفجر شود. نباید نیترات آمونیوم را در نزدیکی مواد منفجره نگهداری شود.
نیترات آمونیوم مذاب به شوک و انفجار، خصوصاً اگر به مواد ناسازگاری مانند مواد قابل احتراق، مایعات قابل اشتعال، اسیدها، کلراتها، کلریدها، گوگرد، فلزات، زغال چوب و خاک اره بسیار حساس است. تماس با برخی از مواد مانند کلرات ها، اسیدهای معدنی و سولفیدهای فلزی می تواند منجر به تجزیه شدید نیترات آمونیوم شود که قادر به اشتعال مواد قابل احتراق در مجاورت خود است و یا حتی منفجر میشود. نیترات آمونیوم پس از ذوب شدن شروع به تجزیه و NOx, HNO۳, NH
۳ و H۲O آزاد می کند.
نیترات آمونیوم نباید در فضاهای محبوس در معرض حرارت قرار بگیرد. گرما و فشار حاصل از تجزیه نیترات آمونیوم باعث افزایش حساسیت به انفجار و افزایش سرعت تجزیه می شود. انفجار نیترات آمونیوم ممکن است در اتمسفری با فشار ۸۰ رخ دهد. عدم خلوص این ماده شیمیایی می تواند این میزان را به ۲۰ یکا کاهش دهد.
نیترات آمونیوم دارای رطوبت نسبی بحرانی ۵۹.۴٪ است که بالاتر از این میزان باعث جذب رطوبت جو میشود. بنابراین، مهم است که نیترات آمونیوم در یک ظرف محکم سربسته نگهداری شود. در غیر این صورت، می تواند به یک توده بزرگ و جامد تبدیل شود. نیترات آمونیوم می تواند رطوبت کافی را برای مایع شدن جذب کند. ترکیب نیترات آمونیوم با سایر کودهای دیگر می تواند رطوبت نسبی بحرانی را کاهش دهد.
برای سلامتی خطرناک نیست و معمولاً در محصولات کودی استفاده می شود. متوسط دوز کشنده نیترات آمونیوم ۲۲۱۷ میلی گرم در کیلوگرم است که حدود دو سوم نمک خوراکی است. نیترات آمونیوم در اثر گرم شدن به صورت غیر منفجره به گاز اکسید نیتروژن و بخار آب تجزیه میشود. با این حال، می توان با انفجار باعث تجزیه انفجاری نیترات آمونیوم شد. انبارهای بزرگ نکهداری مواد نیز به دلیل اکسیداسیون می توانند دارای خطرات عمده آتش سوزی باشند، وضعیتی که به راحتی می تواند منجر به انفجار شود. نیترات آمونیوم می تواند از طریق دو مکانیسم منفجر شود:
• انتقال شوک به انفجار: یک بار انفجاری درون یا در تماس با توده ای از نیترات آمونیوم باعث انفجار نیترات آمونیوم می شود.
• انتقال تخلیه به مرحله انفجار: انفجار نیترات آمونیوم در نتیجه آتش سوزی گسترش یافته به نیترات آمونیوم یا ترکیب نیترات آمونیوم با ماده قابل احتراق در هنگام آتش سوزی. برای انتقال موفقیت آمیز از آتش به یک انفجار، آتش باید حداقل تا حدی محبوس شود.